Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PROM2Q8N271 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROM2Q8N271 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms