Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJD3Q8N144 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms