Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG10Q8N0Z9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG10Q8N0Z9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms