Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN4BQ8IWT1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms