Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC117Q8IWD4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms