Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL3Q8IVW4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL3Q8IVW4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms