Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms