Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLNKQ7Z7G1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms