Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B0

CCDC91, Coiled-coil domain-containing protein 91, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC91Q7Z6B0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC91Q7Z6B0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC91Q7Z6B0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms