Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC11Q7Z392 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms