Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTF1AQ7RTS3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTF1AQ7RTS3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms