Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC80Q76M96 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms