Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13LQ71F56 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MED13LQ71F56 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1526 ms