Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CENPUQ71F23 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPUQ71F23 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms