Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2R2Q712K3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms