Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00173Q6ZV60 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms