Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT98

TTLL7, Tubulin polyglutamylase TTLL7, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL7Q6ZT98 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL7Q6ZT98 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTLL7Q6ZT98 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms