Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT62

BARGIN, Bargin, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARGINQ6ZT62 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BARGINQ6ZT62 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BARGINQ6ZT62 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BARGINQ6ZT62 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BARGINQ6ZT62 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BARGINQ6ZT62 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BARGINQ6ZT62 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BARGINQ6ZT62 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BARGINQ6ZT62 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BARGINQ6ZT62 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BARGINQ6ZT62 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
BARGINQ6ZT62 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BARGINQ6ZT62 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms