Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPTNQ6XPR3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPTNQ6XPR3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPTNQ6XPR3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPTNQ6XPR3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms