Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CASC2Q6XLA1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms