Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRIG3Q6UXM1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIG3Q6UXM1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms