Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF7Q6Q0C0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms