Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO38Q6PIJ6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms