Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TTC41PQ6P2S7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms