Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H3F3CQ6NXT2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H3F3CQ6NXT2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H3F3CQ6NXT2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H3F3CQ6NXT2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3CQ6NXT2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3CQ6NXT2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3CQ6NXT2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3CQ6NXT2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3CQ6NXT2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H3F3CQ6NXT2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3CQ6NXT2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H3F3CQ6NXT2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms