Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNP1Q6NT89 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms