Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL3Q6DD88 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms