Protein–RNA interactions for Protein: Q68CR1

SEL1L3, Protein sel-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEL1L3Q68CR1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEL1L3Q68CR1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEL1L3Q68CR1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms