Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CREB3L3Q68CJ9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CREB3L3Q68CJ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CREB3L3Q68CJ9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms