Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGAP9Q5VTM2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms