Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PXDC1Q5TGL8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PXDC1Q5TGL8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PXDC1Q5TGL8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PXDC1Q5TGL8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PXDC1Q5TGL8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PXDC1Q5TGL8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PXDC1Q5TGL8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms