Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF648Q5T619 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF648Q5T619 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms