Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C10orf55Q5SWW7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms