Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms