Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR44Q5JSH3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR44Q5JSH3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms