Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAN3Q58A45 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms