Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KHDC3LQ587J8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms