Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB6CQ53S08 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms