Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C4orf46Q504U0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf46Q504U0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms