Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM259Q4ZIN3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms