Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC01620Q4KN68 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms