Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms