Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCU0

Putative uncharacterized protein FLJ37770, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3ZCU0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3ZCU0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3ZCU0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3ZCU0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3ZCU0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3ZCU0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3ZCU0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3ZCU0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3ZCU0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3ZCU0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3ZCU0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3ZCU0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms