Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC25A52Q3SY17 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A52Q3SY17 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms