Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms