Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM2Q2VYF4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
LETM2Q2VYF4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
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