Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL40Q2TBA0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL40Q2TBA0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL40Q2TBA0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms