Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC6LQ2NKX8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms