Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKIDA1Q1XH10 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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