Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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SGCAQ16586 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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SGCAQ16586 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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SGCAQ16586 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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SGCAQ16586 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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SGCAQ16586 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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SGCAQ16586 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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SGCAQ16586 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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SGCAQ16586 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCAQ16586 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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SGCAQ16586 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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SGCAQ16586 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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SGCAQ16586 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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SGCAQ16586 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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SGCAQ16586 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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